Team:GO Paris-Saclay/Collaborations

Collaborations

Collaborations

Коллаборации

We proposed two collaborations to the other teams : one of them helped us with the project and the other was for fun.

Nous avons proposé deux collaborations aux autres équipes : l'une nous a aidé sur le projet et l'autre était pour le plaisir.

Мы предложили два варианта сотрудничества другим командам: одна из них помогла нам с проектом, а другая была для развлечения.

Enquête sur l'endométriose

Endometriosis survey

Опрос об эндометриозе

Une enquête pour nous aider avec les Pratiques Humaines sur la cognition de la maladie dans la communauté iGEM. Tous les résultats sont présentés dans la page Pratiques Humaines. Nous avons eu 135 réponses, d'iGEMers du monde entier.

A survey to help us with Human Practices about the cognition of the disease in the iGEM community. All the results are presented in the Human Practices page. We had 135 answers, from iGEMers from all around the World.

Опрос, который поможет нам разобраться в человеческих практиках в познании болезни в сообществе iGEM. Все результаты представлены на странице Human Practices. У нас было 135 ответов от iGEMers со всего мира.


#igemmonumentchallenge

Collaboration instagram. Le principe est de faire et de poster quelques photos d'un monument/œuvre d'art de la ville d'où vient l'équipe avec notre hashtag sur Instagram afin de montrer la beauté de la ville d'où vient l'équipe à nos communautés. Le but est de montrer le côté multiculturel de l'iGEM, et d'en voir un peu plus sur les villes d'où sont originaires les équipes.
Un grand merci à iGEM Aix-Marseille, KCL UK, Toulouse INSA-UPS, UParis BME, Nantes, Bonn-Rheinbach, IISER Berhampur, Kaiserslautern, Tuebingen, Sorbonne U Paris, MSP-Maastricht, TU Darmstadt, Bielefeld-CeBiTec, Groningen , ULaval, Marburg, Wageningen UR, TU-Eindhoven, Concordia-Montreal, Lund, NAWI-Graz, Aboa, NTNU-Trondheim, Aachen, Linkoping Suède, TecCEM, UiOslo Norvège et BOKU-Vienne pour leur participation à notre défi.

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#igemmonumentchallenge

Instagram collaboration. The principle is to make and post some photos of a monument/piece of artwork from the city where the team is from with our hashtag on Instagram in order to show the beauty of the city where the team is from to our communities. The goal is to show the multicultural side of the iGEM, and to see a little bit more about the cities where the teams are from.
A big thank you to iGEM Aix-Marseille, KCL UK, Toulouse INSA-UPS, UParis BME, Nantes, Bonn-Rheinbach, IISER Berhampur, Kaiserslautern, Tuebingen, Sorbonne U Paris, MSP-Maastricht, TU Darmstadt, Bielefeld-CeBiTec, Groningen, ULaval, Marburg, Wageningen UR, TU-Eindhoven, Concordia-Montreal, Lund, NAWI-Graz, Aboa, NTNU-Trondheim, Aachen, Linkoping Sweden, TecCEM, UiOslo Norway and BOKU-Vienna for their participation to our challenge.

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#igemmonumentchallenge

Сотрудничество в Instagram. Принцип состоит в том, чтобы сделать и опубликовать несколько фотографий памятника / произведения искусства из города, откуда команда, с нашим хэштегом в Instagram, чтобы показать красоту города, откуда команда, нашим сообществам. Цель состоит в том, чтобы показать мультикультурную сторону iGEM и узнать немного больше о городах, из которых прибыли команды.
Большое спасибо iGEM Aix-Marseille, KCL UK, Toulouse INSA-UPS, UParis BME, Nantes, Bonn-Rheinbach, IISER Berhampur, Kaiserslautern, Tuebingen, Sorbonne U Paris, MSP-Maastricht, TU Дармштадт, Билефельд-Селебельд , ULaval, Marburg, Wageningen UR, TU-Eindhoven, Concordia-Montreal, Lund, NAWI-Graz, Aboa, NTNU-Trondheim, Aachen, Linkoping Sweden, TecCEM, UiOslo Norway и BOKU-Vienna за их участие в нашем вызове.

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En tant qu'équipe iGEM, nous avons dû collaborer avec d'autres équipes du monde entier ! Sur cette carte, vous pouvez avoir un aperçu des équipes avec lesquelles nous avons collaboré.

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As an iGEM Team, we had to collaborate with other teams from all around the World ! On this map you can have an overview of the teams we collaborated with.

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Как команде iGEM, нам приходилось сотрудничать с другими командами со всего мира! На этой карте вы можете получить обзор команд, с которыми мы сотрудничали.

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Collaborations scientifiques

IISER Kolkata
image cascade Voyons tout d'abord quelle collaboration scientifique nous avons faite avec l'équipe IISER Kolkata. Nos deux équipes travaillant sur la détection de miARN, nous avons échangé nos séquences afin de tester la capacité de nos méthodes de détection respectives à détecter un miARN de l'autre équipe. Nos deux projets étant également basés sur l'utilisation de la protéine Cas13a, nous avons fourni nos protocoles de production et de purification à l'équipe IISER Kolkata qui n'a pas pu la produire.

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Notre réunion Zoom avec iGEM IISER Kolkata.

Scientific collaborations

IISER Kolkata
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First of all let’s see what scientific collaboration we did with Team IISER Kolkata. Our two teams working on miRNA detection, we exchanged our sequences in order to test the ability of our respective detection methods to detect a miRNA from the other team. Our two projects also being based on the use of Cas13a protein, we provided our production and purification protocols to the IISER Kolkata team which could not produce it.

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Our Zoom Meeting with iGEM IISER Kolkata.


Научное сотрудничество

IISER Kolkata
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Прежде всего, давайте посмотрим, какое научное сотрудничество мы сделали с командой IISER Kolkata. Две наши команды, работающие над обнаружением miRNA, обменялись последовательностями, чтобы проверить способность наших соответствующих методов обнаружения обнаруживать miRNA от другой команды. Наши два проекта также основаны на использовании белка Cas13a, мы предоставили наши протоколы производства и очистки команде IISER из Калькутты, которая не смогла их воспроизвести.

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Наша встреча Zoom с iGEM IISER Kolkata.


UParis_BME - test Quentin’s software py-ARN for Toeholds.


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Pour l'équipe de l'U Paris, nous avons évalué le choix des microARN pour leur système. Initialement, lors du développement du projet, nous avons créé un logiciel pour évaluer le croisement/liaison possible des microARN entre eux avant que la réaction ne se produise. En raison du fait que les microARN sont de petite taille, une telle liaison peut avoir un impact important sur la réponse globale.
Nous avons estimé le niveau de chevauchements possibles dans deux situations - une version simplifiée avec des microARN linéaires et prenant en compte la structure secondaire. Malheureusement, nous n'avons pas pu utiliser l'estimation de la structure secondaire en raison d'un manque de puissance de calcul (environ 1 an). Ainsi, si vous disposez d'une puissance de calcul, vous pouvez tester notre programme sur vos microARN.

UParis_BME - test Quentin’s software py-ARN for Toeholds.


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For the U Paris team, we evaluated the choice of microRNA for their system. Initially, during the development of the project, we created a Software to evaluate the possible crossing / binding of microRNAs with each other before the reaction occurs. Due to the fact that microRNAs are quite small in size, such binding can have a large impact on the overall response.
We estimated the level of possible overlaps in two situations - a simplified version with linear microRNA and taking into account the secondary structure. Unfortunately, we could not use the secondary structure estimate due to lack of computing power (about 1 year). Therefore, if you have computing power, you can test our program on your microRNAs.

UParis_BME - тестирование программного обеспечения для Toeholds.

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Для команды UParis_BME мы оценили выбор microRNA для их системы. Первоначально, во время разработки проекта, мы создали программное обеспечение для оценки возможного пересечения / связывания микроРНК друг с другом до того, как произойдет реакция. Из-за того, что микроРНК довольно малы по размеру, такое связывание может иметь большое влияние на общий ответ.
Мы оценили уровень возможных перекрытий в двух ситуациях - упрощенный вариант с линейной микроРНК и с учетом вторичной структуры. К сожалению, мы не смогли использовать оценку вторичной структуры из-за нехватки вычислительной мощности (около 1 года). Поэтому, если у вас есть вычислительные мощности, вы можете протестировать нашу программу на своих микроРНК.


Chaque équipe iGEM est vraiment créative lorsqu'il s'agit de collaborations. Nous n'avons pas pu faire toutes les collaborations proposées mais nous en avons fait quelques-unes. Certains d'entre eux ont pris beaucoup de temps et d'autres ne faisaient que répondre à des sondages !

En septembre 2021 les équipes iGEM (Aix-Marseille, Toulouse INSA-UPS and Nantes Evry Paris-Saclay, Ionis Paris, Sorbonne U Paris, UParis BME, Paris Bettencourt) ont organisées ensemble un événement virtuel via la plateforme ZOOM, afin de se rassembler et d’accueillir d’autres équipes iGEM. L’après-midi a été ponctué entre les présentations des différents projets des équipes, ainsi que des mini-conférences par des intervenants dans les domaines de la biologie synthétique et du science communication et des mini-jeux. Dans ce cadre, nous avons présenté notre projet, en choisissant de l’aborder sous la loupe de nos recherches sur l’endométriose dans l’histoire et l’histoire de l’art. Vous trouverez une partie de nos recherches sur ce thème dans la page Human Practices.

Equipe MSP-Maastricht
L'équipe de Maastricht collecte des articles rédigés par d'autres équipes afin de créer un journal iGEM complet (MSP Vector) contenant des articles sur les projets de cette année. L'article que nous proposons d'inclure dans cette revue décrit le contexte et le principe de la partie scientifique de notre projet. Il décrit également la méthode de production et de purification de nos protéines ainsi que nos résultats à ce sujet.



Equipe iGEM Unizar
Nous avons choisi une chanson de notre pays (Nekfeu - On verra) et une chanson pour travailler au labo (Comme un Homme - Bande originale de Mulan). L'objectif de cette collaboration est d'avoir une liste de lecture iGEM sur Spotify.

Équipe iBowu-Chine
Le but de cette collaboration « BioDoodle » est, pour l'équipe iBowu-Chine, de réaliser un livre de coloriage. Nous devions choisir un sujet dans leur liste, et nous avons choisi « l'histologie », afin de le faire sur l'endomètre (dessiné par Polina Rapoport).

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Équipe NYCU-Taipei
Enquête sur un produit de santé (Natto) guérissant la thrombose.

Équipe NEYCFLS_Chine
Enquête sur le Tye-Dye et les masques contre le COVID-19.

Équipe Athènes
L'objectif de leur projet est la production in vivo de dNTP et d'ADN polymérase pour une PCR in situ one-pot, en espérant que ce projet contribuera à l'accessibilité et à la décentralisation de la production de dNTP. Pour cette raison, ils avaient besoin de l'aide d'autres équipes ! Afin de rendre leur produit adapté aux besoins des autres, ils ont réalisé un sondage auquel nous avons répondu.

Équipe TAS Taipei
Leur projet vise à résoudre le problème de pénurie de sang en utilisant les enzymes nécessaires pour convertir les groupes sanguins en groupe sanguin universel O négatif. Ils ont créé un sondage pour recueillir des informations sur les connaissances et les opinions du public sur le processus de don de sang, nous y avons donc répondu.

Équipe KCIS_New Taipei
Nous avons répondu à un sondage réalisé par cette équipe pour les aider à modifier leur projet. Ils travaillent sur l'utilisation de probiotiques pour lutter contre la carence en vitamine D.

Équipe SUNY Oneonta
Cette équipe étudie le besoin d'une base de données matérielle pour les pièces non biologiques. Ils ont donc fait une enquête à laquelle nous avons répondu sur la nécessité de cela.

Equipe TU_Kaiserslautern
Ils veulent savoir ce que les gens de différents pays connaissent au sujet du génie génétique et en quoi l'attitude à son égard diffère. Alors, ils ont fait un sondage auquel nous avons répondu et diffusé (nous avons mis un lien dans notre story instagram et dans notre bio instagram et avons demandé à certaines associations de l'Université de le diffuser).

Équipe UM_Macao
Cette équipe veut faire un album photo des plats servis avec de la bière dans différents pays. Alors quelqu'un dans notre équipe a mangé une Flammekueche (un repas pour l'Alsace, dans l'Est de la France) et a pris une photo.

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Equipe TU Darmstadt
Cette équipe est en train de faire une vidéo appelée iJET, avec d'autres équipes se filmant en train d'envoyer un avion en papier, nous nous sommes donc filmés en train de le faire.

Equipe ARIA (Barcelone)
Nous avons répondu à une enquête sur la résistance aux antibiotiques.

Equipe Nantaise
L'équipe de Nantes nous a demandé de faire une courte vidéo d'un membre de l'équipe disant bonjour et de quelle équipe ils appartiennent dans leur propre langue, ils ont donc fait une compilation des vidéos.

Every iGEM Team is really creative when it is about collaborations. We haven’t been able to do every collaboration proposed but we did a few. Some of them took a lot of time and some were just about answering surveys !

French Meet-up : In September 2021 the french-teams (Aix-Marseille, Toulouse INSA-UPS and Nantes Evry Paris-Saclay, Ionis Paris, Sorbonne U Paris, UParis BME, Paris Bettencourt) organised a virtual event to gather them and other teams. The afternoon was split between presentations of the different projects, and presentations from intervenants about synthetic biology but also science communication. We presented our lab project and the research about Endometriosis in History and History of Art. You can learn more about it on our Human Practices page.

Team MSP-Maastricht

The Maastricht team is collecting articles made by other teams in order to make a whole iGEM journal (MSP Vector) containing articles on this year’s projects. The article we propose for inclusion in this journal describes the background and principle of the scientific part of our project. It also describes the method of production and purification of our proteins as well as our results on this subject.



Team iGEM Unizar
We chose one song from our country (Nekfeu - On verra) and one song for working in the lab (Comme un Homme - Bande originale de Mulan). The goal of this collaboration is to have an iGEM Playlist on Spotify.

Team iBowu-China
The goal of this collaboration “BioDoodle'' is, for the iBowu-China team, to make a coloring book. We had to choose a topic in their list, and we chose “histology”, in order to do it about the endometrium (drawn by Polina Rapoport).
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Team NYCU-Taipei
Survey about a health product (Natto) curing thrombosis.

Team NEYCFLS_China
Survey about Tye-Dye and masks against COVID-19.

Team Athens
The aim of their project is the in vivo production of dNTPs and DNA polymerase for an in situ one-pot PCR hoping this project will help with the accessibility and decentralization of dNTP production. For this reason they needed help from other teams! In order to make their product tailored to other people’s needs, they made a survey that we answered.

Team TAS Taipei
Their project aims to solve the blood shortage problem by using the enzymes necessary to convert blood types to the universal blood type O negative. They created a survey to gather information on public knowledge and opinions on the blood donation process, so we answered it.

Team KCIS_New Taipei
We answered a survey made by this team to help them modify their project. They are working on using probiotics to combat vitamin D deficiency.

Team SUNY Oneonta
This team is looking into the need for a Hardware Database for non-biological parts. So they made a survey that we answered about the need for it.

Team TU_Kaiserslautern
They want to find out how much people in different countries know about genetic engineering and how the attitude towards it differs. So, they made a survey that we answered and spread (we put a link in our instagram story and in our instagram bio and asked some associations of the University to spread it).

Team UM_Macau
This team wants to make a photo album of the dishes served with beer in different countries. So someone in our team ate a Flammekueche (a meal for Alsace, in the East of France) and took a picture.

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Team TU Darmstadt
This team is making a video called iJET, with other teams filming themselves sending a paper plane, so we filmed ourselves doing it.

Team ARIA (Barcelona)
We answered a survey about antibiotic resistance.

Team Nantes
Team Nantes asked us to make a short video of someone from the team saying Hello and which team they are from in their own language, so they made a compilation of the videos.

Каждая команда iGEM по-настоящему креативна, когда речь идет о сотрудничестве. Мы не смогли выполнить все предложенные варианты сотрудничества, но сделали несколько. Некоторые из них занимали много времени, а некоторые просто отвечали на опросы!

Французская встреча: в сентябре 2021 года французские команды (Aix-Marseille, Toulouse INSA-UPS and Nantes Evry Paris-Saclay, Ionis Paris, Sorbonne U Paris, UParis BME, Paris Bettencourt) организовали виртуальное мероприятие, чтобы собрать их и другие команды.

Во второй половине дня были представлены презентации различных проектов и презентации участников о синтетической биологии, а также о научном общении. Мы представили проект нашей лаборатории и исследования по эндометриозу в истории и истории искусства. Вы можете узнать больше об этом на нашей странице «Человеческие практики».

Команда MSP-Маастрихт
Команда Маастрихта собирает статьи, написанные другими командами, чтобы создать целый журнал iGEM (MSP Vector), содержащий статьи о проектах этого года. Статья, которую мы предлагаем для включения в этот журнал, описывает предысторию и принципы научной части нашего проекта. Он также описывает метод производства и очистки наших белков, а также наши результаты по этому вопросу.



Команда iGEM Unizar
Мы выбрали одну песню из нашей страны (Nekfeu - On verra) и одну песню для работы в лаборатории (Comme un Homme - Bande originale de Mulan). Цель этого сотрудничества - создать плейлист iGEM на Spotify.

Команда iBowu-Китай
Цель этого сотрудничества «BioDoodle» - для команды iBowu-China создать книжку-раскраску. Нам нужно было выбрать тему из их списка, и мы выбрали «гистологию», чтобы заняться эндометрием.(нарисовано Полиной Рапопорт).

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Команда NYCU-Тайбэй
Обзор продукта для здоровья (Натто), излечивающего тромбоз.

Команда NEYCFLS_China
Обзор о Тай-Дай и масках против COVID-19.

Команда Athens
Целью их проекта является производство dNTP и ДНК-полимеразы in vivo для однореакторной ПЦР in situ, надеясь, что этот проект поможет сделать производство dNTP доступным и децентрализованным. По этой причине им требовалась помощь других команд! Чтобы адаптировать свой продукт к потребностям других людей, они провели опрос, на который мы ответили.

Команда ТАС Тайбэй
Их проект направлен на решение проблемы нехватки крови с помощью ферментов, необходимых для преобразования группы крови в универсальную отрицательную группу крови. Они создали опрос, чтобы собрать информацию об общедоступных знаниях и мнениях о процессе донорства крови, поэтому мы ответили на него.

Команда KCIS_New Taipei
Мы ответили на опрос, проведенный этой командой, чтобы помочь им изменить свой проект. Они работают над использованием пробиотиков для борьбы с дефицитом витамина D.

Команда SUNY Oneonta
Эта команда изучает потребность в базе данных оборудования для небиологических компонентов. Поэтому они провели опрос, и мы ответили о необходимости этого.

Команда TU_Kaiserslautern
Они хотят узнать, насколько люди в разных странах знают о генной инженерии и чем различаются отношения к ней. Итак, они провели опрос, на который мы ответили и распространили (мы поместили ссылку в нашу историю в Instagram и в нашу биографию в Instagram и попросили некоторые ассоциации университета распространить ее).

Команда UM_Macau
Эта команда хочет сделать фотоальбом блюд, которые подают к пиву в разных странах. Итак, кто-то из нашей команды съел Flammekueche (еда для Эльзаса, на востоке Франции) и сфотографировал.

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Команда ТУ Дармштадт
Эта команда снимает видео под названием iJET, другие команды снимают самих себя, отправляя бумажный самолетик, поэтому мы снимали, как делаем это.

Команда ARIA (Барселона)
Мы ответили на опрос об устойчивости к антибиотикам.

Команда Нант
Команда Nantes попросила нас сделать короткое видео, на котором кто-то из команды говорит «Привет» и из какой команды он на своем родном языке, поэтому они сделали подборку видео.


Petites rencontres que nous avons eues :

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La première réunion Zoom avec une autre équipe était avec iGEM Ionis Paris. Nous nous sommes rencontrés, avons parlé de nos équipes et nous avons joué à des jeux en ligne.

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iGEM IISER Tirupati : une petite réunion pour parler de nos projets, car nos deux projets traitent d'un sujet tabou. Pour eux, il s'agit de contraception.

Enfin, nous avons rencontré quelqu'un de la TU Delft lorsque nous étions à Amsterdam en septembre avec Lund, et la Team RUBochum avec Sorbonne à Paris.

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L'équipe Human Practices rencontre iGEM Lund et iGEM TU Delft à Amsterdam.

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Enzo, de notre équipe a rencontré iGEM Sorbonne et iGEM Bochum à Paris.

Little meetings we had :

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The first Zoom Meeting with another team was with iGEM Ionis Paris. We met, talked about our teams and we played some games online.

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iGEM IISER Tirupati : a little meeting to talk about our projects, because both our projects are about a taboo issue. For them, it is about contraception.

Finally, we met someone from TU Delft when we were in Amsterdam in September with Lund, and the Team RUBochum with Sorbonne in Paris.

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The Human Practices Team meeting iGEM Lund and iGEM TU Delft in Amsterdam.

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Enzo, from our team met iGEM Sorbonne and iGEM Bochum in Paris.

LУ нас были небольшие встречи:/b>

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TПервая встреча Zoom с другой командой была с iGEM Ionis Paris. Мы встретились, поговорили о наших командах, поиграли в онлайн-игры.br>
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iiGEM IISER Tirupati: небольшая встреча, чтобы поговорить о наших проектах, потому что оба наших проекта посвящены табу. Для них это контрацепция.<

FНаконец, мы встретили кого-то из TU Delft, когда мы были в Амстердаме в сентябре с Лундом, и Team RUBochum с Sorbonne U Paris в Париже.

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TГруппа специалистов по человеческим практикам встречается с iGEM Lund и iGEM TU Delft в Амстердаме.br>
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EЭнцо, из нашей команды познакомился с iGEM Sorbonne, iGEM Bochum в Париже.