Difference between revisions of "Team:HUST-China/Parts"

(Prototype team page)
 
 
(6 intermediate revisions by 3 users not shown)
Line 1: Line 1:
−
{{IGEM_TopBar}}
+
<!-- # TODO: #6 Fix table caption font-->
−
{{HUST-China}}
+
<!-- # TODO: #7 Fix citations links font size-->
−
<html>
+
<html lang="en">
−
 
+
−
 
+
−
<div class="column full_size">
+
−
<h1>Parts</h1>
+
−
<p>Each team will make new parts during iGEM and will add them to the Registry of Standard Biological Parts. iGEM provides an easy way to present the parts your team has created. The <code>&lt;groupparts&gt;</code> tag (see below) will generate a table with all of the parts that your team adds to your team sandbox.</p>
+
−
<p>Remember that the goal of proper part documentation is to describe and define a part, so that it can be used without needing to refer to the primary literature. Registry users in future years should be able to read your documentation and be able to use the part successfully. Also, you should provide proper references to acknowledge previous authors and to provide for users who wish to know more.</p>
+
−
</div>
+
−
 
+
−
<div class="column full_size">
+
−
<div class="highlight decoration_background">
+
−
<h3>Note</h3>
+
−
<p>Note that parts must be well documented on each Part's Main Page on the <a href="http://parts.igem.org/Main_Page">Registry</a>. This documentation includes all of the characterization data for your parts. <b>The part's data MUST be on the part's Main Page on the Registry for your team to be eligible for medals and special prizes pertaining to parts.</b> <br><br>
+
−
This page serves to <i>showcase</i> the parts you have made and should include links to the Registry pages for your parts. Future teams and other users are much more likely to find parts by looking in the Registry than by looking at your team wiki.</p>
+
−
</div>
+
−
</div>
+
−
 
+
−
<div class="clear extra_space"></div>
+
−
<div class="line_divider"></div>
+
−
<div class="clear extra_space"></div>
+
−
 
+
−
 
+
−
 
+
−
 
+
−
 
+
−
<div class="column full_size">
+
−
<div class="highlight decoration_B_full">
+
−
 
+
−
<h3>Adding parts to the Registry</h3>
+
−
<p>You can add parts to the Registry at our <a href="http://parts.igem.org/Add_a_Part_to_the_Registry">Add a Part to the Registry</a> link.</p>
+
−
 
+
−
<p>We encourage teams to start adding and documenting their parts on the Registry as soon as they can. Once you add your parts to the Registry, you can continue to add documentation to them throughout the iGEM season (up until the Registry freeze). This will allow you to remember all the details about your parts and store their history in the wiki. Documentation includes the characterization data of your parts.</p>
+
−
<div class="button_link">
+
−
<a href="http://parts.igem.org/Add_a_Part_to_the_Registry">
+
−
ADD PARTS
+
−
</a>
+
−
</div>
+
−
 
+
−
</div>
+
−
</div>
+
−
 
+
−
 
+
−
 
+
−
<div class="column third_size">
+
−
<div class="highlight decoration_A_full">
+
−
<h3>Inspiration: Basic Parts</h3>
+
−
<p>We have a created  a <a href="http://parts.igem.org/Well_Documented_Parts">collection of well documented parts</a> that can help you get started.</p>
+
−
 
+
−
<p> You can also take a look at the following examples for Basic Parts on the Registry:</p>
+
−
<ul>
+
−
<li><a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K3114006">2019 Calgary </a></li>
+
−
<li><a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K3027000">2019 GO Paris Saclay</a></li>
+
−
<li><a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K3187028">2019 TU Darmstadt</a></li>
+
−
<li><a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K3552000">2020 Links China</a></li>
+
−
<li><a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K3558000">2020 UNSW Australia</a></li>
+
−
<li><a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K3338002">2020 Hannover</a></li>
+
−
</ul>
+
−
</div>
+
−
</div>
+
−
 
+
−
<div class="column third_size">
+
−
<div class="highlight decoration_A_full">
+
−
<h3>Inspiration: Composite Parts</h3>
+
−
<p>We have a created  a <a href="http://parts.igem.org/Well_Documented_Parts">collection of well documented parts</a> that can help you get started.</p>
+
−
 
+
−
<p> You can also take a look at the following examples for Composite Parts on the Registry:</p>
+
−
<ul>
+
−
<li><a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K3198007">2019 NUS Singapore </a></li>
+
−
<li><a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2932003">2019 Mingdao</a></li>
+
−
<li><a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2980009">2019 Tsinghua</a></li>
+
−
 
+
−
<li><a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K3407022">2020 TUDelft</a></li>
+
−
<li><a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K3380500">2020 Edinburgh</a></li>
+
−
<li><a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K3512042">2020 BITSPilani Goa India</a></li>
+
−
</ul>
+
−
</div>
+
−
</div>
+
−
 
+
−
 
+
−
 
+
−
<div class="column third_size">
+
−
 
+
−
<h3>What information do I need to start putting my parts on the Registry?</h3>
+
−
<p>The information needed to initially create a part on the Registry is:</p>
+
−
<ul>
+
−
<li>Part Name</li>
+
−
<li>Part type</li>
+
−
<li>Creator</li>
+
−
<li>Sequence</li>
+
−
<li>Short Description (60 characters on what the DNA does)</li>
+
−
<li>Long Description (Longer description of what the DNA does)</li>
+
−
<li>Design considerations</li>
+
−
</ul>
+
−
 
+
−
<p>
+
−
We encourage you to put up <em>much more</em> information as you gather it over the summer. If you have images, plots, characterization data and other information, you must also put it up on the part page. </p>
+
−
 
+
−
</div>
+
−
 
+
−
 
+
−
<div class="clear extra_space"></div>
+
−
<div class="line_divider"></div>
+
−
<div class="clear extra_space"></div>
+
−
 
+
−
<div class="column full_size">
+
−
<h3>Part Table </h3>
+
−
 
+
−
<p>Please include a table of all the parts your team has made during your project on this page. Remember part characterization and measurement data must go on your team part pages on the Registry. </p>
+
−
 
+
−
</html>
+
−
<groupparts>iGEM20 HUST-China</groupparts>
+
−
<html>
+
−
</div>
+
−
 
+
  
 +
<head>
 +
    <meta charset="utf-8" />
 +
    <meta content="width=device-width,initial-scale=1" name="viewport" />
 +
    <link href="https://2021.igem.org/Template:HUST-China/css/contentCSS?action=raw&amp;ctype=text/css"
 +
        rel="stylesheet" />
 +
    <title>Parts | iGEM HUST-China</title>
 +
    <link href="https://2021.igem.org/Template:HUST-China/css/contentCSS?action=raw&amp;ctype=text/css"
 +
        rel="stylesheet" />
 +
</head>
  
 +
<body>
 +
    <!-- # TODO: #6 Fix table caption font-->
 +
    <!-- # TODO: #7 Fix citations links font size-->
 +
    <nav class="navbar navbar-expand-xl fixed-top">
 +
        <div class="container d-flex justify-content-between"><a class="navbar-brand"
 +
                href="https://2021.igem.org/Team:HUST-China"><i class="navbar-logo-left"></i><span>HUST-China</span></a>
 +
            <button aria-controls="navbarNav" aria-expanded="false" aria-label="Toggle navigation"
 +
                class="navbar-toggler" data-target="#navbarNav" data-toggle="collapse" type="button"><span
 +
                    class="navbar-toggler-icon"></span>
 +
            </button>
 +
            <div class="collapse navbar-collapse" id="navbarNav">
 +
                <ul class="navbar-nav ml-auto">
 +
                    <li class="nav-item dropdown"><a aria-expanded="false" aria-haspopup="true"
 +
                            class="nav-link dropdown-toggle" data-toggle="dropdown" href="#" id="navbarProjectDropdown"
 +
                            role="button">Project</a>
 +
                        <div aria-labelledby="navbarProjectDropdown" class="dropdown-menu"><a class="dropdown-item"
 +
                                href="https://2021.igem.org/Team:HUST-China/Description">Description</a><a
 +
                                class="dropdown-item" href="https://2021.igem.org/Team:HUST-China/Design">Design</a><a
 +
                                class="dropdown-item"
 +
                                href="https://2021.igem.org/Team:HUST-China/Proof_Of_Concept">Proof of
 +
                                Concept</a><a class="dropdown-item"
 +
                                href="https://2021.igem.org/Team:HUST-China/Safety">Safety</a><a class="dropdown-item"
 +
                                href="https://2021.igem.org/Team:HUST-China/Implementation">Proposed
 +
                                Implementation</a><a class="dropdown-item"
 +
                                href="https://2021.igem.org/Team:HUST-China/Contribution">Contribution</a>
 +
                        </div>
 +
                    </li>
 +
                    <li class="nav-item dropdown"><a aria-expanded="false" aria-haspopup="true"
 +
                            class="nav-link dropdown-toggle" data-toggle="dropdown" href="#"
 +
                            id="navbarHuman PracticesDropdown" role="button">Human Practices</a>
 +
                        <div aria-labelledby="navbarHuman PracticesDropdown" class="dropdown-menu"><a
 +
                                class="dropdown-item"
 +
                                href="https://2021.igem.org/Team:HUST-China/Human_Practices">Overview</a><a
 +
                                class="dropdown-item"
 +
                                href="https://2021.igem.org/Team:HUST-China/Human_Practices_01">Part
 +
                                1</a><a class="dropdown-item"
 +
                                href="https://2021.igem.org/Team:HUST-China/Human_Practices_02">Part
 +
                                2</a><a class="dropdown-item"
 +
                                href="https://2021.igem.org/Team:HUST-China/Collaborations">Part
 +
                                3</a><a class="dropdown-item"
 +
                                href="https://2021.igem.org/Team:HUST-China/Education">Part 4</a>
 +
                        </div>
 +
                    </li>
 +
                    <li class="nav-item dropdown"><a aria-expanded="false" aria-haspopup="true"
 +
                            class="nav-link dropdown-toggle" data-toggle="dropdown" href="#" id="navbarModelingDropdown"
 +
                            role="button">Modeling</a>
 +
                        <div aria-labelledby="navbarModelingDropdown" class="dropdown-menu"><a class="dropdown-item"
 +
                                href="https://2021.igem.org/Team:HUST-China/Model">Overview</a><a class="dropdown-item"
 +
                                href="https://2021.igem.org/Team:HUST-China/Gene_Pathway">Gene
 +
                                Pathway</a><a class="dropdown-item"
 +
                                href="https://2021.igem.org/Team:HUST-China/Dye_color_forecast">Dye color
 +
                                forecast</a><a class="dropdown-item"
 +
                                href="https://2021.igem.org/Team:HUST-China/Micronucleus_Counter">Micronucleus
 +
                                Counter</a></div>
 +
                    </li>
 +
                    <li class="nav-item dropdown"><a aria-expanded="false" aria-haspopup="true"
 +
                            class="nav-link dropdown-toggle" data-toggle="dropdown" href="#" id="navbarProductsDropdown"
 +
                            role="button">Products</a>
 +
                        <div aria-labelledby="navbarProductsDropdown" class="dropdown-menu"><a class="dropdown-item"
 +
                                href="https://2021.igem.org/Team:HUST-China/Products">Overview</a><a
 +
                                class="dropdown-item"
 +
                                href="https://2021.igem.org/Team:HUST-China/Software">Software</a><a
 +
                                class="dropdown-item"
 +
                                href="https://2021.igem.org/Team:HUST-China/Hardware">Hardware</a><a
 +
                                class="dropdown-item" href="https://2021.igem.org/Team:HUST-China/Another_Area">Another
 +
                                Area</a></div>
 +
                    </li>
 +
                    <li class="nav-item dropdown"><a aria-expanded="false" aria-haspopup="true"
 +
                            class="nav-link dropdown-toggle" data-toggle="dropdown" href="#"
 +
                            id="navbarExperimentsDropdown" role="button">Experiments</a>
 +
                        <div aria-labelledby="navbarExperimentsDropdown" class="dropdown-menu"><a class="dropdown-item"
 +
                                href="https://2021.igem.org/Team:HUST-China/Experiments">Overview</a><a
 +
                                class="dropdown-item" href="https://2021.igem.org/Team:HUST-China/Parts">Parts</a><a
 +
                                class="dropdown-item"
 +
                                href="https://2021.igem.org/Team:HUST-China/Engineering">Engineering
 +
                                Success</a><a class="dropdown-item"
 +
                                href="https://2021.igem.org/Team:HUST-China/Results">Results</a><a class="dropdown-item"
 +
                                href="https://2021.igem.org/Team:HUST-China/Protocol">Protocol</a><a
 +
                                class="dropdown-item" href="https://2021.igem.org/Team:HUST-China/Notebook">Notebook</a>
 +
                        </div>
 +
                    </li>
 +
                    <li class="nav-item dropdown"><a aria-expanded="false" aria-haspopup="true"
 +
                            class="nav-link dropdown-toggle" data-toggle="dropdown" href="#" id="navbarPeopleDropdown"
 +
                            role="button">People</a>
 +
                        <div aria-labelledby="navbarPeopleDropdown" class="dropdown-menu"><a class="dropdown-item"
 +
                                href="https://2021.igem.org/Team:HUST-China/Team">Team</a><a class="dropdown-item"
 +
                                href="https://2021.igem.org/Team:HUST-China/Partnership">Partnership</a><a
 +
                                class="dropdown-item"
 +
                                href="https://2021.igem.org/Team:HUST-China/Attributions">Attributions</a></div>
 +
                    </li>
 +
                    <li class="nav-item dropdown"><a aria-expanded="false" aria-haspopup="true"
 +
                            class="nav-link dropdown-toggle" data-toggle="dropdown" href="#"
 +
                            id="navbarAchievementsDropdown" role="button">Achievements</a>
 +
                        <div aria-labelledby="navbarAchievementsDropdown" class="dropdown-menu"><a class="dropdown-item"
 +
                                href="https://2021.igem.org/Team:HUST-China/Award">Award</a><a class="dropdown-item"
 +
                                href="https://video.igem.org/w/aMwNT6eBryGs8xG5avXD51">Promotion
 +
                                Video</a><a class="dropdown-item"
 +
                                href="https://igem.org/2021_Judging_Form?id=3711">Judging
 +
                                Form</a></div>
 +
                    </li>
 +
                </ul>
 +
            </div>
 +
        </div>
 +
    </nav>
 +
    <div class="navbar-extra fixed-top"></div>
 +
    <header class="d-flex justify-content-center align-items-center">
 +
        <div class="container">
 +
            <h1 id="Top">Parts</h1>
 +
            <p class="lead pl-1"></p>
 +
            <hr class="my-4" />
 +
        </div>
 +
    </header>
 +
    <main>
 +
        <div class="container">
 +
            <div class="row">
 +
                <div class="sidebar col-lg-3">
 +
                    <div class="nav" id="contents">
 +
                        <h5>Contents</h5>
 +
                        <ul></ul>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
                <div class="content col-lg-9">
 +
                    <article>
 +
                        <h1>Introduction</h1>
 +
                        <p>Biology is different from other engineering fields due to a lack of modular nature of the
 +
                            structure and function, which means the expression of gene will change when transferred from
 +
                            one species to another. What synthetic biology is dedicated to is the modularization and
 +
                            standardization of functional gene, to make the expression of it predictable in different
 +
                            chassis organism. Our project has registered 19 basic parts and 56 composite parts, all
 +
                            qualified for standardized requirement of RFC[10]. We have also tested these parts. We hope
 +
                            that everyone can utilize our parts based on our research through registry and that the
 +
                            information for parts can further be completed so that more people can make use of them.</p>
 +
                        <h1>Basic parts</h1>
 +
                        <table>
 +
                            <thead>
 +
                                <tr>
 +
                                    <th>Part</th>
 +
                                    <th>Number</th>
 +
                                    <th>Part Name</th>
 +
                                    <th>Type</th>
 +
                                    <th>length</th>
 +
                                </tr>
 +
                            </thead>
 +
                            <tbody>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td> </td>>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711019">BBa_K3711019</a></td>
 +
                                    <td>Panb1</td>
 +
                                    <td>Regulatory</td>
 +
                                    <td>399</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td> </td>>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711001">BBa_K3711001</a></td>
 +
                                    <td>Pynr071c</td>
 +
                                    <td>Regulatory</td>
 +
                                    <td>1188</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td> </td>>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711015">BBa_K3711015</a></td>
 +
                                    <td>AOX1</td>
 +
                                    <td>Regulatory</td>
 +
                                    <td>937</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td> </td>>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711017">BBa_K3711017</a></td>
 +
                                    <td>AOX1 terminator</td>
 +
                                    <td>Terminator</td>
 +
                                    <td>247</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td> </td>>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711002">BBa_K3711002</a></td>
 +
                                    <td>ROX1</td>
 +
                                    <td>Coding</td>
 +
                                    <td>1251</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td> </td>>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711003">BBa_K3711003</a></td>
 +
                                    <td>FMO</td>
 +
                                    <td>Coding</td>
 +
                                    <td>1395</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td> </td>>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711004">BBa_K3711004</a></td>
 +
                                    <td>Laccase</td>
 +
                                    <td>Coding</td>
 +
                                    <td>1602</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td> </td>>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711005">BBa_K3711005</a></td>
 +
                                    <td>crtE</td>
 +
                                    <td>Coding</td>
 +
                                    <td>927</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td> </td>>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711006">BBa_K3711006</a></td>
 +
                                    <td>crtB</td>
 +
                                    <td>Coding</td>
 +
                                    <td>948</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td> </td>>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711007">BBa_K3711007</a></td>
 +
                                    <td>crtI</td>
 +
                                    <td>Coding</td>
 +
                                    <td>1497</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td> </td>>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711008">BBa_K3711008</a></td>
 +
                                    <td>LOX2</td>
 +
                                    <td>Coding</td>
 +
                                    <td>2709</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711009">BBa_K3711009</a></td>
 +
                                    <td>4CL</td>
 +
                                    <td>Coding</td>
 +
                                    <td>1704</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711010">BBa_K3711010</a></td>
 +
                                    <td>ACC</td>
 +
                                    <td>Coding</td>
 +
                                    <td>1800</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711011">BBa_K3711011</a></td>
 +
                                    <td>CUS</td>
 +
                                    <td>Coding</td>
 +
                                    <td>1227</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711012">BBa_K3711012</a></td>
 +
                                    <td>curA</td>
 +
                                    <td>Coding</td>
 +
                                    <td>1056</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711013">BBa_K3711013</a></td>
 +
                                    <td>PepACS</td>
 +
                                    <td>Coding</td>
 +
                                    <td>168</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711014">BBa_K3711014</a></td>
 +
                                    <td>DsbC</td>
 +
                                    <td>Coding</td>
 +
                                    <td>903</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711016">BBa_K3711016</a></td>
 +
                                    <td>α-factor</td>
 +
                                    <td>Coding</td>
 +
                                    <td>267</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711018">BBa_K3711018</a></td>
 +
                                    <td>FMO dimer</td>
 +
                                    <td>Coding</td>
 +
                                    <td>2769</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                            </tbody>
 +
                        </table>
 +
                        <h1>Improvement</h1>
 +
                        <p>Flaving Containing-Monooxygenase (FMO) is an enzyme that can be used to produce indigo. This
 +
                            basic part has been registered by iGEM13_Berkeley as BBa_K1131000. We improved its function
 +
                            and registered as a new part BBa_K3711018.</p>
 +
                        <p>Firstly, we optimized the codon of this gene according to the codon preference of P.pastoris
 +
                            to improve its expression level.</p>
 +
                        <p>Secondly, research shows that FAD is the prosthetic group of FMO, NADPH is the cofactor of
 +
                            FMO. FMO-FAD-NADPH complex usually forms a asymmetric dimer as a unit to work. The
 +
                            enzyme-substrate complex formed when enzyme acts on substrate, has two dimers per unit[1].
 +
                        </p>
 +
                        <p>So, we wanted to construct the two FMO fusion proteins named FMO dimer and expressed it,
 +
                            hoping that they could form a dimer more easily and improve their activity.</p>
 +
                        <p>Then, we predicted the 3D structure of FMO dimer. The result shows that the structure could
 +
                            be formed and the dimer could combinate with substrate.</p>
 +
                        <p>Therefore, we started to build FMO dimer and achieved success in expression. More details
 +
                            please click here.</p>
 +
                        <h1>Composite parts</h1>
 +
                        <table>
 +
                            <thead>
 +
                                <tr>
 +
                                    <th>Part</th>
 +
                                    <th>Number</th>
 +
                                    <th>Part Name</th>
 +
                                    <th>Type</th>
 +
                                    <th>length</th>
 +
                                </tr>
 +
                            </thead>
 +
                            <tbody>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711039">BBa_K3711039</a></td>
 +
                                    <td>AOX1-α factor-ROX1-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>2722</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711040">BBa_K3711040</a></td>
 +
                                    <td>AOX1-α factor-FMO-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>2866</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711041">BBa_K3711041</a></td>
 +
                                    <td>AOX1-α factor-Laccase-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>3073</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711042">BBa_K3711042</a></td>
 +
                                    <td>AOX1-α factor-crtE-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>2398</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711043">BBa_K3711043</a></td>
 +
                                    <td>AOX1-α factor-crtB-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>2419</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711044">BBa_K3711044</a></td>
 +
                                    <td>AOX1-α factor-crtI-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>2968</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711045">BBa_K3711045</a></td>
 +
                                    <td>AOX1-α factor-LOX2-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>4180</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711046">BBa_K3711046</a></td>
 +
                                    <td>AOX1-α factor-4CL-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>3175</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711047">BBa_K3711047</a></td>
 +
                                    <td>AOX1-α factor-ACC-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>3271</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711048">BBa_K3711048</a></td>
 +
                                    <td>AOX1-α factor-CUS-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>2698</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711049">BBa_K3711049</a></td>
 +
                                    <td>AOX1-α factor-curA-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>2527</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711050">BBa_K3711050</a></td>
 +
                                    <td>AOX1-α factor-PepACS-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>1639</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711051">BBa_K3711051</a></td>
 +
                                    <td>AOX1-α factor-DsbC-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>2374</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711052">BBa_K3711052</a></td>
 +
                                    <td>Pynr071c-α factor-FMO dimer-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>4491</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711053">BBa_K3711053</a></td>
 +
                                    <td>Pynr071c-α factor-ROX1-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>2973</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711054">BBa_K3711054</a></td>
 +
                                    <td>Panb1-α factor-FMO-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>2328</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711055">BBa_K3711055</a></td>
 +
                                    <td>Pynr071c-α factor-Laccase-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>3324</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711056">BBa_K3711056</a></td>
 +
                                    <td>Panb1-α factor-crtE-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>1860</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711057">BBa_K3711057</a></td>
 +
                                    <td>Panb1-α factor-crtB-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>1881</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711058">BBa_K3711058</a></td>
 +
                                    <td>Panb1-α factor-crtI-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>2430</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711060">BBa_K3711060</a></td>
 +
                                    <td>Pynr071c-α factor-LOX2-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>4431</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711061">BBa_K3711061</a></td>
 +
                                    <td>Panb1-α factor-4CL-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>2637</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711062">BBa_K3711062</a></td>
 +
                                    <td>Panb1-α factor-ACC-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>2733</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711063">BBa_K3711063</a></td>
 +
                                    <td>Panb1-α factor-CUS-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>2160</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711064">BBa_K3711064</a></td>
 +
                                    <td>Pynr071c-α factor-curA-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>2778</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711065">BBa_K3711065</a></td>
 +
                                    <td>Panb1-α factor-PepACS-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>1101</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711066">BBa_K3711066</a></td>
 +
                                    <td>Pynr071c-α factor-DsbC-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>2625</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711067">BBa_K3711067</a></td>
 +
                                    <td>Pynr071c-ROX1-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>2700</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711068">BBa_K3711068</a></td>
 +
                                    <td>Panb1-FMO-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>2055</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711069">BBa_K3711069</a></td>
 +
                                    <td>Pynr071c-Laccase-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>3051</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711070">BBa_K3711070</a></td>
 +
                                    <td>Panb1-crtE-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>1587</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711071">BBa_K3711071</a></td>
 +
                                    <td>Panb1-crtB-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>1608</td>
 +
                                 
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711072">BBa_K3711072</a></td>
 +
                                    <td>Panb1-crtI-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>2157</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711073">BBa_K3711073</a></td>
 +
                                    <td>Pynr071c-LOX2-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>4158</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711074">BBa_K3711074</a></td>
 +
                                    <td>Panb1-4CL-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>2364</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711075">BBa_K3711075</a></td>
 +
                                    <td>Panb1-ACC-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>2460</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711076">BBa_K3711076</a></td>
 +
                                    <td>Panb1-CUS-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>1887</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711077">BBa_K3711077</a></td>
 +
                                    <td>Pynr071c-curA-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>2505</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711078">BBa_K3711078</a></td>
 +
                                    <td>Panb1-PepACS-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>828</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711079">BBa_K3711079</a></td>
 +
                                    <td>Pynr071c-DsbC-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>2352</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711080">BBa_K3711080</a></td>
 +
                                    <td>AOX1-α factor-Lycopene-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>7801</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711081">BBa_K3711081</a></td>
 +
                                    <td>AOX1-α factor-Curcumin-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>9160</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711082">BBa_K3711082</a></td>
 +
                                    <td>Panb1-α factor-Curcumin-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>7546</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711083">BBa_K3711083</a></td>
 +
                                    <td>Panb1-α factor-Lycopene-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>6187</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711084">BBa_K3711084</a></td>
 +
                                    <td>Panb1-Curcumin-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>6727</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711085">BBa_K3711085</a></td>
 +
                                    <td>Panb1-Lycopene-AOX1 Terminator</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>5368</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711086">BBa_K3711086</a></td>
 +
                                    <td>The synthesis and decolorization system of indigo</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>8368</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711087">BBa_K3711087</a></td>
 +
                                    <td>The synthesis and decolorization system of indigo</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>7822</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711088">BBa_K3711088</a></td>
 +
                                    <td>The synthesis and decolorization system of indigo</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>14948</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711089">BBa_K3711089</a></td>
 +
                                    <td>The synthesis and decolorization system of lycopene without signal peptide</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>12242</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711090">BBa_K3711090</a></td>
 +
                                    <td>The synthesis and decolorization system of lycopene without signal peptide</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>13040</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711091">BBa_K3711091</a></td>
 +
                                    <td>The synthesis and decolorization system of curcumin without signal peptide</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>11948</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711092">BBa_K3711092</a></td>
 +
                                    <td>The perm and straightening system</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>6442</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td></td>
 +
                                    <td><a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K3711093">BBa_K3711093</a></td>
 +
                                    <td>The perm and straightening system without signal peptide</td>
 +
                                    <td>Composite</td>
 +
                                    <td>5896</td>
 +
                                   
 +
                                </tr>
 +
                            </tbody>
 +
                        </table>
 +
                        <div class="row g-0">
 +
                            <div class="col-4 girl"><img
 +
                                    src="https://static.igem.org/mediawiki/2021/2/28/T--HUST-China--img--girl.png" /></div>
 +
                            <div class="col-5">
 +
                                <div class="dialogbox">
 +
                                    <p>How ingenious! It seems that constructing composite parts and full pathway takes <a href="https://2021.igem.org/Team:HUST-China/Engineering">engineering</a> wisdom.</p>
 +
                                </div>
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                    </article>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
        </div>
 +
    </main>
 +
    <footer>
 +
        <div class="container">
 +
            <div class="row">
 +
                <div class="col-7">
 +
                    <div class="row justify-content-center">
 +
                        <div class="footer-logo"></div>
 +
                    </div>
 +
                    <p><span>CONTACT US: </span><a href="mailto:iGEMHUSTChina@163.com">iGEMHUSTChina@163.com</a></p>
 +
                    <p>Huazhong University of Sci. &amp; Tech., Wuhan, China</p>
 +
                    <p>1037# Luoyu Rd, Wuhan, P.R.China 430074</p>
 +
                    <p>Copyright © <span>HUST-China </span>iGEM 2021</p>
 +
                </div>
 +
                <div class="col-5">
 +
                    <div class="row">
 +
                        <div class="footer-xmind"></div>
 +
                    </div>
 +
                    <div class="row">
 +
                        <div class="footer-snapgene"></div>
 +
                    </div>
 +
                    <div class="row">
 +
                        <div class="footer-NEBI"></div>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
        </div>
 +
    </footer>
 +
    <script
 +
        src="https://2021.igem.org/Template:HUST-China/content-bundleJS?action=raw&amp;ctype=text/javascript"></script>
 +
    <script
 +
        src="https://2021.igem.org/Template:HUST-China/mathjax-bundleJS?action=raw&amp;ctype=text/javascript"></script>
 +
</body>
  
 
</html>
 
</html>

Latest revision as of 14:31, 16 December 2021

Parts | iGEM HUST-China

Parts

Introduction

Biology is different from other engineering fields due to a lack of modular nature of the structure and function, which means the expression of gene will change when transferred from one species to another. What synthetic biology is dedicated to is the modularization and standardization of functional gene, to make the expression of it predictable in different chassis organism. Our project has registered 19 basic parts and 56 composite parts, all qualified for standardized requirement of RFC[10]. We have also tested these parts. We hope that everyone can utilize our parts based on our research through registry and that the information for parts can further be completed so that more people can make use of them.

Basic parts

> > > > > > > > > > >
Part Number Part Name Type length
BBa_K3711019 Panb1 Regulatory 399
BBa_K3711001 Pynr071c Regulatory 1188
BBa_K3711015 AOX1 Regulatory 937
BBa_K3711017 AOX1 terminator Terminator 247
BBa_K3711002 ROX1 Coding 1251
BBa_K3711003 FMO Coding 1395
BBa_K3711004 Laccase Coding 1602
BBa_K3711005 crtE Coding 927
BBa_K3711006 crtB Coding 948
BBa_K3711007 crtI Coding 1497
BBa_K3711008 LOX2 Coding 2709
BBa_K3711009 4CL Coding 1704
BBa_K3711010 ACC Coding 1800
BBa_K3711011 CUS Coding 1227
BBa_K3711012 curA Coding 1056
BBa_K3711013 PepACS Coding 168
BBa_K3711014 DsbC Coding 903
BBa_K3711016 α-factor Coding 267
BBa_K3711018 FMO dimer Coding 2769

Improvement

Flaving Containing-Monooxygenase (FMO) is an enzyme that can be used to produce indigo. This basic part has been registered by iGEM13_Berkeley as BBa_K1131000. We improved its function and registered as a new part BBa_K3711018.

Firstly, we optimized the codon of this gene according to the codon preference of P.pastoris to improve its expression level.

Secondly, research shows that FAD is the prosthetic group of FMO, NADPH is the cofactor of FMO. FMO-FAD-NADPH complex usually forms a asymmetric dimer as a unit to work. The enzyme-substrate complex formed when enzyme acts on substrate, has two dimers per unit[1].

So, we wanted to construct the two FMO fusion proteins named FMO dimer and expressed it, hoping that they could form a dimer more easily and improve their activity.

Then, we predicted the 3D structure of FMO dimer. The result shows that the structure could be formed and the dimer could combinate with substrate.

Therefore, we started to build FMO dimer and achieved success in expression. More details please click here.

Composite parts

Part Number Part Name Type length
BBa_K3711039 AOX1-α factor-ROX1-AOX1 Terminator Composite 2722
BBa_K3711040 AOX1-α factor-FMO-AOX1 Terminator Composite 2866
BBa_K3711041 AOX1-α factor-Laccase-AOX1 Terminator Composite 3073
BBa_K3711042 AOX1-α factor-crtE-AOX1 Terminator Composite 2398
BBa_K3711043 AOX1-α factor-crtB-AOX1 Terminator Composite 2419
BBa_K3711044 AOX1-α factor-crtI-AOX1 Terminator Composite 2968
BBa_K3711045 AOX1-α factor-LOX2-AOX1 Terminator Composite 4180
BBa_K3711046 AOX1-α factor-4CL-AOX1 Terminator Composite 3175
BBa_K3711047 AOX1-α factor-ACC-AOX1 Terminator Composite 3271
BBa_K3711048 AOX1-α factor-CUS-AOX1 Terminator Composite 2698
BBa_K3711049 AOX1-α factor-curA-AOX1 Terminator Composite 2527
BBa_K3711050 AOX1-α factor-PepACS-AOX1 Terminator Composite 1639
BBa_K3711051 AOX1-α factor-DsbC-AOX1 Terminator Composite 2374
BBa_K3711052 Pynr071c-α factor-FMO dimer-AOX1 Terminator Composite 4491
BBa_K3711053 Pynr071c-α factor-ROX1-AOX1 Terminator Composite 2973
BBa_K3711054 Panb1-α factor-FMO-AOX1 Terminator Composite 2328
BBa_K3711055 Pynr071c-α factor-Laccase-AOX1 Terminator Composite 3324
BBa_K3711056 Panb1-α factor-crtE-AOX1 Terminator Composite 1860
BBa_K3711057 Panb1-α factor-crtB-AOX1 Terminator Composite 1881
BBa_K3711058 Panb1-α factor-crtI-AOX1 Terminator Composite 2430
BBa_K3711060 Pynr071c-α factor-LOX2-AOX1 Terminator Composite 4431
BBa_K3711061 Panb1-α factor-4CL-AOX1 Terminator Composite 2637
BBa_K3711062 Panb1-α factor-ACC-AOX1 Terminator Composite 2733
BBa_K3711063 Panb1-α factor-CUS-AOX1 Terminator Composite 2160
BBa_K3711064 Pynr071c-α factor-curA-AOX1 Terminator Composite 2778
BBa_K3711065 Panb1-α factor-PepACS-AOX1 Terminator Composite 1101
BBa_K3711066 Pynr071c-α factor-DsbC-AOX1 Terminator Composite 2625
BBa_K3711067 Pynr071c-ROX1-AOX1 Terminator Composite 2700
BBa_K3711068 Panb1-FMO-AOX1 Terminator Composite 2055
BBa_K3711069 Pynr071c-Laccase-AOX1 Terminator Composite 3051
BBa_K3711070 Panb1-crtE-AOX1 Terminator Composite 1587
BBa_K3711071 Panb1-crtB-AOX1 Terminator Composite 1608
BBa_K3711072 Panb1-crtI-AOX1 Terminator Composite 2157
BBa_K3711073 Pynr071c-LOX2-AOX1 Terminator Composite 4158
BBa_K3711074 Panb1-4CL-AOX1 Terminator Composite 2364
BBa_K3711075 Panb1-ACC-AOX1 Terminator Composite 2460
BBa_K3711076 Panb1-CUS-AOX1 Terminator Composite 1887
BBa_K3711077 Pynr071c-curA-AOX1 Terminator Composite 2505
BBa_K3711078 Panb1-PepACS-AOX1 Terminator Composite 828
BBa_K3711079 Pynr071c-DsbC-AOX1 Terminator Composite 2352
BBa_K3711080 AOX1-α factor-Lycopene-AOX1 Terminator Composite 7801
BBa_K3711081 AOX1-α factor-Curcumin-AOX1 Terminator Composite 9160
BBa_K3711082 Panb1-α factor-Curcumin-AOX1 Terminator Composite 7546
BBa_K3711083 Panb1-α factor-Lycopene-AOX1 Terminator Composite 6187
BBa_K3711084 Panb1-Curcumin-AOX1 Terminator Composite 6727
BBa_K3711085 Panb1-Lycopene-AOX1 Terminator Composite 5368
BBa_K3711086 The synthesis and decolorization system of indigo Composite 8368
BBa_K3711087 The synthesis and decolorization system of indigo Composite 7822
BBa_K3711088 The synthesis and decolorization system of indigo Composite 14948
BBa_K3711089 The synthesis and decolorization system of lycopene without signal peptide Composite 12242
BBa_K3711090 The synthesis and decolorization system of lycopene without signal peptide Composite 13040
BBa_K3711091 The synthesis and decolorization system of curcumin without signal peptide Composite 11948
BBa_K3711092 The perm and straightening system Composite 6442
BBa_K3711093 The perm and straightening system without signal peptide Composite 5896

How ingenious! It seems that constructing composite parts and full pathway takes engineering wisdom.

CONTACT US: iGEMHUSTChina@163.com

Huazhong University of Sci. & Tech., Wuhan, China

1037# Luoyu Rd, Wuhan, P.R.China 430074

Copyright © HUST-China iGEM 2021